Tens os tópicos não lidos desde a ultima visita, e todos os tópicos não lidos.
Alguns tópicos deixam de aparecer na lista dos tópicos não lidos desde a ultima visita ao fim de algum tempo, no entanto continuam por ler.
Quando chegas ao fim de abrir os tópicos não lidos aparece uma mensagem, a dizer que não há mais mensagens, e a dizer se queres ver todas os tópicos não lidos, ou algo assim do género (não me lembro o que diz em concreto) e se carregares no link dessa mensagem aparecem todos os tópicos não lidos.
A forma mais rápida de ver todos os tópicos não lidos, é pores "all" no endereço da pagina com a lista de tópicos não lidos.
Ex: - renaultpt.com/index.php?action=unread;all;start=0
Depois ainda há a questão das opções de não notificação de alguns quadros, ai nesse caso tens que ir alterar ao teu perfil.
Basicamente é tudo o que pode fazer com que num sitio tenhas uma lista de mensagens não lidas e no outro não. Verifica estas situações.