Os contras é que vais ter de usar toda a parte elétrica desse mesmo motor mais recente... o que encarece a parte financeira da coisa e as dores de cabeça para o instalador.
Portanto, o ideal, é mesmo optares por motor que encaixe aà no Clio, e quanto muito, escolher um mais recente, por exemplo de 2004 a 2006, porque depois disso, já não dão.